In den ehrenamtlich tätigen Führungsgremien der Bürgerstiftung Norden sind deren Aufgaben und die der vielen Helfer und Mitstreiter klar verteilt. Der aus vier Mitgliedern bestehende Vorstand führt die laufenden Geschäfte, legt die konkreten Ziele und Prioritäten sowie das Konzept der Projektarbeit fest.

Vorstandsvorsitzender ist Dr. Matthias Stenger. Ihm zur Seite stehen Ralf Homberg (zuständig für Finanzen, Bilanz und Steuern), Barbara Schlag (Schriftführerin) und Dr. Jörg Hagena. Der Stiftungsbeirat unter Führung von Matthias Fuchs (Vorsitzender) und Hans-Bernd Eilers (Stellvertreter) berät den Vorstand und versteht sich als Kontrollgremium. Das dritte Organ ist der Stifterrat, dem auf Lebenszeit Personen angehören, die als Stifter oder Zustifter ab einem festgelegten Betrag zum Stiftungsvermögen beigetragen haben.